Kanal tedavisi yapılmış dişlerde çeşitli sebeplerden ötürü her zaman başarı elde edilemeyebilir. Böyle durumlarda yapılan radyolojik ve klinik muayeneler sonucunda diş kökünde cerrahi uygulamaları gerekebilmektedir. Bu cerrahiler esnasında kök ucundaki enfeksiyon temizlenerek kök ucu sızdırmaz materyaller ile kapatılmaktadır. Bu cerrahilere Mikro-Endodontik Cerrahiler ismi verilmektedir.